拟研究或解决的问题:
蛋白质的三级结构预测是目前蛋白质化学领域中最具挑战行的问题之一。同源模建是一个根据模板蛋白将一级序列转成3D结构的技术总称，在很多软件中都提供了相应的功能，做的最好的商业软件是INSIGHTii和modeller。同源模建技术给我们带来了更多选择和探索新领域的机会，但是注意，如果你的蛋白同源性不高，波动性过大，关键位点差异显著的话，要谨慎的选择同源模建，因为这样构造出来的蛋白很可能误导你后面的工作，因为往往同源模建在我们这里都是一个课题的第一步，决定了后面这个课题是否成功的关键。
一般认为好的模板能够模建出好的蛋白质模型，因此在我们的研究中，我们拟构建一个基于结构比对的profile模板库，用该模板库进行搜索同源模板和序列比对，再通过MODELLER的get-model程序，模建出蛋白质的三级结构，最后进行蛋白质三级结构的模型评估，评估主要采用的RMSD和TMscore。
采用的研究手段
一MODELLER的安装
1下载：
到MODELLER的官网上下载符合自己电脑版本的MODELLER；
下载地址：http://salilab.org/modeller/
选择DownloadInstallation选项，下载合适的版本。（本次以MODELLER9.13通用版为例）。
2解压：
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