消化系统癌症基因组研究文献综述

开题报告内容：

一、研究目的

消化系统癌症在癌症中的发病率最高而且死亡率也最高。本课题以消化系统癌症中的肝癌作为一个例子，对其基因组进行详细的研究。目前大多数的肝癌患者年龄大约是在40-60岁之间，然而也有部分患者的年龄在20-40岁之间，呈现出年轻化的特点。因此针对这样的情况，本课题采用外显子测序方法，找到其突变位点。并且希望找到青年患肝癌与中年患肝癌的基因突变的不同之处。从而可以利用合理的药物设计方法靶向针对突变基因，以提高其治愈率。

二、研究内容

人类基因组序列图谱的完成以及遗传多样性的进一步揭示且绘制了初步的单体型图，标志着肿瘤研究进入了后基因组时代。肝细胞癌是世界常见的恶性肿瘤之一，恶性程度较高，治疗效果差，而且预后较差。肝癌的发病率在不同地区有很大的差异。流行病学研究表明,全球每年约有62万新增病例,而且随着全球化进一步加剧,过去25年不仅在发展中国家,在一些西发达国家其发病率及死亡率也呈逐年上升之势。但其发生、发展及转移的内在分子机理作用仍未很好阐明,一直是肿瘤研究领域热点问题。因此，本课题打算以青年肝癌基因组作为研究对象，以二代测序作为研究手段，找到其基因组中发生突变的位点，并将其与中老年肝癌患病人群的的基因突变位点进行比较，找到其独特的突变位点。

三、研究手段

①文献研究法

通过上网查找国内外相关的文献资料，获取目前其他研究人员对青年肝癌基因组的研究情况，以及目前二代测序技术最新研究方法和手段。得到一般性的结论和新的思路。

②实验法

首先从临床获得标本，进行测序前的处理，使用二代测序仪器获得其相应的基因的碱基序列。其次使用数据分析软件找到其基因突变的位置，然后通过sanger测序法对找到的突变位点进行进一步的验证。最后与常见（中老年）肝癌突变位点进行比较，找到新的突变位点。