一、选题背景和意义：
单细胞RNA-seq是一项在2009年首次发表的测序技术，可以测定细胞中有多少种RNA，每种RNA含量有多少。在研究组织异质性、细胞分化和发育、疾病发生发展上有重要作用。
ATAC-seq是一项测定染色质开放程度的测序技术，可以反映出染色质的转录活性状态，在研究基因表达调控、表观遗传图谱绘制、细胞分化和发育以及各类疾病的发生发展时具有重要作用。
单细胞或单核的RNA-seq揭示了细胞的转录状态，而染色质可及性测序（ATAC-seq）揭示了相关的调控状况。目前对两种数据的研究策略是分别对这些模式进行分析，然后进行计算整合，可能无法精确地描述细胞状态和分子生物学过程。
本课题在同一细胞内对两种组学信息进行联合分析将使转录调控与其结果直接匹配，从而可以更准确地重建细胞生理学背后的分子过程。
二、课题关键问题及难点：
关键问题：
使用合适的分析方法，充分利用两种数据来源于同一细胞这一特点；
难点：
在以往的研究当中两种数据来自于不同细胞，在做分析时都是对两种数据分别处理，然后进行计算整合，可能无法充分利用一些信息。现在利用在同一细胞中测得的数据，应该采用联合分析的策略进行数据融合，才能更加准确地描述细胞状态和重建分子生物学进程。
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