开题报告内容:(包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述,不少于2000字)
研究发现,人体内共存在61种溴结构域,分布在人体46条染色体中,根据系统和结构可以分为8类,溴结构域和超末端结构域(BET)家族属于第二类,由四个家族成员组成,分别是BRD2, BRD3, BRD4和BRDT。每个BET家族成员都包含两个N-末端溴域(BDI和BDII)和C-末端溴域【1】。
在人体内的不同细胞中,同种基因的转录状态是不同的。因此,虽然人体内的所有细胞均含有相同的基因序列,但是神经细胞与皮肤细胞的功能各异【2】。基因转录的过程受到组蛋白上可逆的赖氨酸乙酰化调控,在人体总共有3种酶参与了该调控过程,BET溴域家族蛋白正是其中之一。它们选择性地和组蛋白上乙酰化赖氨酸发生特异性结合,最终促进基因转录、翻译和蛋白质的合成等过程。当癌症或炎症发生时,BET家族成员的表达上调,导致促生长基因和促炎症细胞因子表达异常【3】。阻断赖氨酸乙酰化与溴域相互作用的可以发挥治疗肿瘤作用,因此开发了一系列BET抑制剂。例如,在2009年三菱田边制药公司公布了第一个BET抑制剂(1a,MS417)【4】。随后,Dana Farber癌症研究所发现了另一种结构相近的抑制剂(1b,JQ1)【5】。这2种化合物占据了乙酰化结合位点,且都是有效的BET家族蛋白选择性抑制剂。在心血管临床试验Ⅱ期,Resverlogix公司发现一款新型BET抑制剂RVX-208【6】。在早期研究的基础上,关于BET抑制剂的研究得到了快速发展,在抗肿瘤治疗机制中,发现BET抑制剂存在3种作用机制:(1)阻断细胞周期控制,终止了G1过程 (2)抑制肿瘤形成的渠道基因,导致肿瘤细胞凋亡 (3)阻断了趋化因子和细胞因子的信号通路,破坏了有利于肿瘤细胞生存的体内微环境【7】。目前,BET家族多种抑制剂的Ⅰ期或Ⅱ期临床实验正在进行中。相关研究结果表明,BET抑制剂单药或联合现有药物在治疗多种肿瘤中均有明确的效果。因此,其有望成为肿瘤治疗的新靶点。
研究证明,在肿瘤、心力衰竭和病毒感染等疾病中,BET家族的成员-BRD4参与其基因调控。鉴于BRD4广泛的疾病相关性,也为了证明阻断BRD4 -乙酰-赖氨酸相互作用是一个疾病治疗靶点,研究者们付出了巨大的努力去开发BRD4抑制剂。药物开发者使用了许多筛选手段,包括高通量筛选(HTS)和中通量筛选筛选(MTS),虚拟筛选(VS),基于碎片的药物设计(FBDD),基于结构的药物设计(SBDD)以及药物再利用【8】。目前,已报道的BRD4抑制剂在化学结构上可分为几大类,包括3,5-二甲基异恶唑、吡啶酮、三氮唑、四氢喹啉(THQs), 4-酰基吡咯,2-噻唑烷酮等。
2017年的Abbvie公司提出了一种全新的吡啶酮类化合物(1),并且根通过结构修饰得到了一个生化效能较为优秀的产物74b。在对74b进行了体内有效性检测事发现在多发性骨髓瘤(OPM2)小鼠异种移植模型中,以每日一次的频率,按照1mg/kg 和 2mg/kg 的剂量每日连续灌胃21天,2种剂量下,均表现出良好的耐受性,并表现出剂量依赖性肿瘤生长抑制(TGI)作用,而在药物治疗期结束后肿瘤则又恢复生长,表明化合物74b具有很好抗肿瘤效果【7】。上述实验可以有效的说明吡啶酮类抑制剂在治疗肿瘤上的潜在价值。
值得注意的是,Abbvie公司报道另一款吡啶酮类抑制剂ABBV-075已经进入了临床Ⅰ期试验阶段。通过共晶分析发现,化合物ABBV-075与其他BET抑制剂一样都是通过氢键与BRD4 KAc结合达到抑制效果的。吡咯并[2,3-c]吡啶酮中的羰基氧和吡咯的胺基与BRD4(BD2)蛋白中的保守氨基Asn433形成了两个氢键来与BRD4 KAc结合;而2,4-二氟苯基占据了BET蛋白的WPF疏水性位点,提高化合物的细胞活性(苯环上的二氟取代基可以很好的降低了整体电性,改善稳定性,降低清除率);同时,磺酰胺中的磺酰基取代了口袋中的水分子,与ZA channal 中的Asp377形成了氢键【7】。通过这三处相互作用,ABBV-075对BET蛋白产生高效抑制作用。
根据上述的构效关系,我们设计了一类新的哒嗪酮类化合物(如下图所示)。通过与ABBV-075进行对接分析发现,哒嗪酮环上的羰基氧可以很好的与保守氨基Asn433氢键,酰胺部分可以与BC loop上His437 产生一个作用力,而苯基醚结构可以很好的进入WPF疏水性口袋。同时,磺酰胺结构会与与Asp377形成氢键。有了这3处关键性的相互作用,化合物有很大几率具备BET蛋白抑制能力。
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