基于SRM技术的HIF-1α及其羟化修饰的靶向定量文献综述

 2023-02-24 23:14:37

利用质谱定量缺氧诱导因子HIF蛋白的研究进展摘 要缺氧诱导因子(Hypoxia inducible factor,HIF)是一种转录因子蛋白,普遍存在于哺乳动物细胞内,起着氧调节的作用。

HIF在缺氧环境中可以稳定存在,但在常氧环境中,HIF-1alpha;蛋白会在脯氨酸羟化酶(Prolyl Hydroxylase,PHD)的作用下被羟化,经过泛素-蛋白酶体通路被迅速降解。

因此,通过激活或抑制PHD的活性可以对HIF的表达水平进行调控。

利用传统方法对HIF蛋白水平进行检测比较困难,且定量结果不准确。

新型的靶向定量蛋白质的选择离子监测质谱技术(Selected Reaction Monitoring, SRM)可以用于定量HIF-1alpha;及其羟化后的蛋白水平,相比于传统的Western-blot技术,SRM具有更高的灵敏度和重复性,技术操作简便快捷,且不需要抗体作为靶标,是一种低成本、高效率的蛋白定量方法。

关键词:缺氧诱导因子-1alpha;;脯氨酸羟化酶;蛋白质定量;选择离子监测质谱正 文1、缺氧诱导因子HIF-1的结构缺氧诱导因子HIF-1是一种异源二聚体,包含HIF-1alpha;与HIF-1beta;两个不同的亚基,前者是功能性亚基,在常氧环境中很容易被降解,但在缺氧环境中可以稳定存在,所以HIF-1alpha;是通过调节氧的浓度来调节HIF活性的。

而后者是HIF-1的结构亚基,是一种芳香烃受体核转运蛋白(ARNT),在细胞内稳定表达[1]。

HIF-1alpha;在所有细胞中都有表达但在正常氧环境中,检测不到其存在,只有在缺氧环境中,alpha;亚基和beta;亚基才能结合,形成活性HIF-1。

HIF二聚体与缺氧反应元件启动子或增强子结合,启动了在细胞中下游基因的转录。

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